La resistencia genética a enfermedades de raíz es poco frecuente, y en la agricultura estas enfermedades se controlan mediante prácticas tales como la rotación de cultivos y la fumigación del suelo. Sin embargo, las plantas han desarrollado una estrategia para estimular y mantener grupos específicos de microorganismos rizosféricos antagonistas como defensa contra enfermedades causadas por patógenos del suelo. La producción de antibióticos por muchas de estas bacterias juega un papel significativo en la defensa de las plantas, y se dispone actualmente de información detallada sobre la genética, bioquímica y regulación de la síntesis de varios de los antibióticos comúnmente producidos. Además, muchos genes que contribuyen a la habilidad de estas cepas para colonizar raíces han sido identificados y estudios de suelos naturalmente supresivos han aportado evidencias de interacciones preferenciales entre la planta huésped y la bacteria biocontroladora, revelando la existencia de diversidad funcional entre cepas muy relacionadas de las poblaciones protectoras. En el presente trabajo consideramos cómo este conocimiento puede ser aplicado a un mejor manejo de la microflora rizosférica indígena, ayudando en la selección de enmiendas microbianas más efectivas, y guiando en el diseño de la microflora a través de la manipulación genética dirigida para mejorar la salud y productividad de los cultivos.

Thomashow, L. S. & Weller, D. M. (2005). Uso sustentable de los recursos genéticos microbianos en la agricultura agentes de control biológico. Agrociencia, 9(1-2), pp.  317-320.