Las interacciones bacteria-bacteria determinan la composición poblacional, la relación con el entorno y el funcionamiento de las comunidades microbianas complejas. El estudio de la composición de la microbiota del ecosistema intestinal y de alimentos fermentados funcionales, es indispensable para comprender el rol de determinados microorganismos en la salud y para diseñar y mejorar la formulación de probióticos. El logro de estos objetivos implica la utilización de diversos tipos de metodologías a los efectos de obtener información referente a la identidad y diversidad de los microorganismos involucrados. En este sentido es importante destacar que el uso de métodos microbiológicos convencionales basados en el aislamiento y cultivo de microorganismos es tan importante como la utilización de métodos basados en ácidos nucleicos para microorganismos viables no cultivables (VNC).

De Antoni, G. L. (2005). Identificación y tipificación de microorganismos aislados de comunidades complejas: productos fermentados naturales y microbiota intestinal. Agrociencia, 9(1-2), pp.  385-386.