En el segundo volumen de La rebelión de Túpac Amaru II se nota una mayor diferencia en cuanto a la composición documental del mismo en relación con la edición primigenia. Para este volumen se ha incorporado parte de la documentación del antiguo volumen dos, especialmente todos aquellos documentos referentes a sucesos previos a la rebelión, que hemos agrupado como «Antecedentes», en donde se incorpora un documento sobre la revolución de los pasquines de Cusco de 1780, que originalmente había sido reproducido en el primer libro de la Colección Documental del Bicentenario de la Rebelión de Túpac Amaru en los años ochenta. En la segunda parte, que está enfocada en evidenciar los costos de la guerra desde el bando realista, que se ha denominado como «Asuntos económicos», se ha incorporado gran parte de la documentación relativa que se publicó en el cuarto volumen de la primera edición y seis documentos adicionales publicados en el tercero. La gran cantidad de información de esta índole nos demuestra la complejidad del sistema colonial español, y su pervivencia dentro de una situación de clara crisis política y económica.
La investigación, recopilación y prólogo de la primera edición estuvo a cargo del Dr. Carlos Daniel Valcárcel (3 vols.) y el Dr. Guillermo Durand Flórez (1 vol.). Esta nueva edición incluye además la documentación publicada en la Colección Documental del Bicentenario de la Rebelión de Túpac Amaru II cuya investigación y recopilación estuvo a cargo del Dr. Luis Durand Flórez.
Huerto, H. (Ed.). (2017). Nueva Colección Documental de Independencia del Perú: La rebelión de Túpac Amaru II. Volumen 2. Lima: ACUEDI Ediciones, UPC, Fondo Editorial del Congreso de la República del Perú, Fundación M. J. Bustamante de la Fuente y Red de Investigadores Indigenistas.